《妖精的旋律》讲述头部两侧各有类似猫耳的角，被称为二觭人（ディクロニウス）的女性变异人(新人类或超能力者)，因为具有毁灭人类的力量，位于日本神奈川县镰仓市外海的离岛上的国立生态研究所，便机密地将这些女孩隔离起来并加以研究。 某日，研究所内发生重大的意外事故。原本被隔离的二觭人少女-露西，因为不明人士的暗中帮忙，得以突破拘束装置，并分尸了所内23位武装警卫，连研究所室长-藏间的女秘书-如月都惨遭杀害。虽然狙击手以穿甲弹瞄准她的头部开枪，却仅击破其铁头盔；露西虽然头部受伤流血并坠入海中，仍得以幸存并成功逃亡。
